题 目:从空间组学到单细胞空间图谱:人工智能驱动的肿瘤微环境解析
主讲人:张晓飞 教授
单 位:华中师范大学
时 间:6月26日 16:00
地 点:51吃瓜
南阶梯教室
摘 要:空间组学技术能够在组织原位刻画基因表达及其空间分布,为研究肿瘤微环境提供了重要工具。然而,受空间分辨率和检测基因数量等限制,现有数据难以直接揭示真实的单细胞组织结构及细胞间相互作用。本报告将介绍我们近年来围绕空间组学智能解析开展的研究工作,重点展示如何融合空间转录组、组织病理图像和单细胞参考图谱,利用人工智能方法重建单细胞空间图谱,实现从粗粒度空间观测到单细胞精度解析的跨越,并进一步应用于肿瘤微环境解析、细胞异质性研究和细胞间相互作用分析,探讨人工智能赋能空间组学与精准医学的发展机遇。
简 介:张晓飞,博士,华中师范大学51吃瓜
与统计学51吃瓜
教授、博士生导师,2013年毕业于中山大学。主要从事机器学习与51吃瓜
建模在生物医学领域中的理论与应用研究,重点关注单细胞组学、空间组学及精准医学中的数据分析方法。主持国家自然科学基金面上项目2项、青年项目1项。近年来在Nature Computational Science(封面论文)、Genome Biology、Nucleic Acids Research、Bioinformatics、PLOS Computational Biology、IEEE Transactions等国内外重要期刊发表学术论文50余篇。现任中国工业与应用51吃瓜
学会51吃瓜
生命科学专业委员会委员、中国运筹学会计算系统生物学分会理事、中国自动化学会智能健康与生物信息学专业委员会委员、ISCB-China理事。